所辖部门

食品和营养局
食品和营养局，负责推行营养教育和培训计划，宣传科学和合理的营养，向低收入家庭发放食品券，以及采取其他措施消除贫困、饥饿和营养不良，对特定人群实行专项食物计划等。负责自然资源和环境保护的机构有林业局和土地保护局。林业局管理全国的森林。野生动物、稀有植物、鱼类、放牧地、娱乐场所，指导林业研究、保护和管理，以及矿物和能源的管理；土地保护局负责土地、水和其他农业资源的保护，控制水土流失和盐碱化，改善对湿地、草原等的保护和管理。
销售和检验局
销售和检验局也是一个担负多种重要职能的部门，它要确保粮食安全，包括肉类和禽、蛋的检验，收获前的安全检查，病原体控制计划，杀虫剂残毒监控等；负责农产品的销售，制定农产品等级标准并核发证书，开展谷物检验，实行销售规程及研究与促销计划，直接销售和批发市场的开发计划，农产品的运输和销售之间的协调；制定动植物进出口法规并实行动植物检疫，动植物病害的监控，推行生物防治，兽医保健，等等。
负责农业的机构
负责农业的研究、教育和经济学的有7个机构，其中主管农业研究、教育和推广的就有3个局，即农业推广局、农业研究局、州合作研究局，从另一个侧面反映了科学研究对提高美国农业生产率的巨大贡献；经济研究局是十分重要的部门，其主要职能包括农业现状与未来的分析和展望、提供经济和农村社会方面的研究报告，帮助国会和行政当局制订和评价农业和农村政策，汇集各种资料，例如：美国和世界对农业生产资料和各种农产品的需求，农业生产和销售中的成本和利润，政府政策和计划对农场主、农村居民和自然资源的影响等等；国家农业统计局，其职责是及时、准确、客观地提供统计信息，发布州和全国的统计数字，并对各种农产品的生产、价格与劳务等问题进行预测，为美国农业和农村社区服务；世界农业展望委员会，它是全球农产品市场预测的中心；国家农业图书馆，它是美国三大图书馆之一，也是世界上最大的农业图书馆。
美国农业部的机构设置及其职能基本适应美国现代化农业发展的要求。美国政府经常在不同程度上对经济活动进行干预，既要保障生产者和消费者的利益，又要确保在法律、法规许可的范围内实行公平竞争，政府为此必须提供多方面的服务，使效率和公平二者取得恰当的平衡。